На пустой базе не возникнет таких ошибок при обновлении ИБ как то неуникальные записи в регистре сведений, не прошедшие обработчики обновления и так далее. Поэтому иногда имеет смысл подключаться к уже существующей базе и проводить проверки и тесты на ней.